VASP6.3.0安装(CPU, GPU)版本

VASP6.3.0 CPU 版本安装

环境

CPU版本的VASP非常好安装,只需要Intel OneAPI就可以了。(仅针对Intel的CPU。AMD的CPU手上暂时还没有,但是可以用AOCC的库来安装,详情请看

下载Linux版本的Intel® oneAPI Base Toolkit  和 Intel® oneAPI HPC Toolkit ,没有特别需求,保持新就是好的想法下载最新版。

安装之前先安装gcc, g++

sudo apt-get install gcc

sudo apt-get install g++

最好进去图形界面安装,使用sudo权限安装上述两个Toolkit

sudo ./install

安装路径放在你的/shared/softwares里面,(根据NFS配置更改),然后source oneAPI环境

source /shared/softwares/intel/oneapi/setvars.sh

:: initializing oneAPI environment ...
-bash: BASH_VERSION = 5.0.17(1)-release
args: Using "$@" for setvars.sh arguments:
:: advisor -- latest
:: ccl -- latest
:: clck -- latest
:: compiler -- latest
:: dal -- latest
:: debugger -- latest
:: dev-utilities -- latest
:: dnnl -- latest
:: dpcpp-ct -- latest
:: dpl -- latest
:: inspector -- latest
:: ipp -- latest
:: ippcp -- latest
:: ipp -- latest
:: itac -- latest
:: mkl -- latest
:: mpi -- latest
:: tbb -- latest
:: vpl -- latest
:: vtune -- latest
:: oneAPI environment initialized ::

出现上述内容说明环境配置成功!

安装

解压vasp.6.3.0.tgz到/shared/softwares/中

cd /shared/softwares/

tar -zxvf vasp.6.3.0.tgz

cd /vasp.6.3.0

复制/arch文件夹中的makefile.include.intel到上一级目录,并改名成makefile.include

cp /arch makefile.include.intel ../makefile.include

多核编译安装加快速度,N为CPU核数

make -jN all

单核编译可能要几个小时,多核的话喝杯茶就好了,如果有什么报错,复制去问ChatGPT4.


VASP6.3.0 GPU 版本安装

VASP从6.3.0版本之后移除了CUDA-C接口的支持,更改为OpenACC,资源利用更加高效(应该。link

驱动及运行库NVIDIA GPU驱动,NVHPC(提供数学库MKL,并行MPI,FORTRAN,QD),CUDA TookitFFTW3

NVIDIA相关的驱动和库在官网都有教程,这里就不再赘述,要注意的是安装NVIDIA GPU驱动时需要关闭自带的nouveau驱动。这个在安装驱动的时候它可以自动生成一个驱动黑名单,一般来说仔细看看上面说了什么,然后无脑重启就能禁用了,如果不行的话根据这里自行禁用nouveau驱动


FFTW3

下面仅介绍如何编译安装FFTW3。在连接中下载FFTW3,解压到/shard/softwares/

tar -zxvf fftw-3.3.10.tar.gz

cd fftw-3.3.10

./configure --prefix=/shared/softwares/fftw310 --enable-mpi

–prefix= 指fftw3的安装目录,主要最好和源码目录分开,–enable-mpi 指启用mpi优化(大概

make all

make install


对于NVIDIA相关的驱动和库,如果你是在自己的集群上安装的,可以安装在/shared/softwares文件夹里面,然后用module load的方法调用这些库,也可以统一安装在默认路径(但是这样必须保证版本相同)。

完成安装上述库后,复制一份vasp.6.3.0源码,并且重命名为vasp.6.3.0_gpu

tar -zxvf vasp.6.3.0.tgz

mv /vasp.6.3.0 vasp.6.3.0_gpu

cd vasp.6.3.0_gpu

复制/arch文件夹中的makefile.include.nvhpc到上级目录并重命名为makefile.include

cp /arch makefile.include.nvhpc ../makefile.include

加载相关的库,这里给的是默认路径

export PATH=/opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/23.5/compilers/bin/:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/shared/softwares/fftw3310/lib:$LD_LIBRARY_PATH

更改makefile.include中第19,20行,-gpu=ccXX,XX代表显卡等级?(应该可以这么说)。对于P100 这里XX=60,根据自己的cuda版本修改cudaXX.X的内容,我这里用的是12.1。

vim makefile.include (不管,vim就是最好的文本编辑器!!!

FC = mpif90 -acc -gpu=cc60,cuda12.1
FCL = mpif90 -acc -gpu=cc60,cuda12.1 -c++libs

更改makefile.include中第67行,QD的绝对路径

QD = /opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/23.5/compilers/extras/qd

更改makefile.include中第78行,FFTW的绝对路径

FFTW_ROOT = /shared/softwares/fftw310

保存退出。GPU版本只能单核编译。

make all

bin文件夹里面有vasp_std, vasp_gam, vasp_ncl就说明安装成功了!

贴上我的makefile.include(放大看)

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